株式会社 Cancer Precision Medicine

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シングルセルRNAシーケンス解析

10x GenomicsのChromiumシングルセル遺伝子発現システムを用い、シングルセルの特性解析および遺伝子発現プロファイリングを行います。不均一な細胞集団の特徴を詳細に評価することができます。
(本項目は、Theragen Bio.(弊社関係会社、韓国)にて実施いたします。)

特長

  • シングルセルレベルで細胞の特性を解析し、細胞集団内の不均一性を特定
  • トランスクリプトーム解析により、遺伝子発現プロファイリングを網羅的に取得
  • 分子バーコード(UMI)を用いたPCR Duplicateや増幅バイアスの除去による、高精度な発現解析

解析内容

10x Genomics Chromiumプラットフォームにより、細胞の単離およびシングルセルライブラリーの作製を行い、Illuminaシーケンサーを用いてシーケンスを行います。取得したリードをゲノム参照配列にマッピング後、細胞バーコードやUMIのカウント数に基づき、細胞のクラスタリングや発現解析を実行します。

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ご提出いただくサンプル

以下の条件を満たさない場合や、ウイルス等による感染性が疑われるサンプルの場合は事前にご相談ください。Theragen Bio.にてサンプルの品質確認を実施し、品質を満たさない場合はご連絡いたします。

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価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

以下を納品いたします。

  • 各共通:解析報告書
  • データ解析なし:シーケンスデータ(Fastq)
  • データ解析あり:シーケンスデータ(Fastq)、Cell rangersデータ、Seurat R package

納品方法:ファイル転送(FTP)

ご依頼方法

詳細は「受託解析サービス ご利用案内」をご参照ください。

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留意事項

  • 本項目は、Theragen Bio.(韓国)にて実施いたします。
  • 倫理審査を要する研究に本サービスの結果をご利用される場合は、ご所属機関における倫理審査委員会の承認を得たうえでご依頼ください。詳細は、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託解析サービスについて」をご確認ください。
  • サンプルにウイルス等による感染を疑うべき事情がある場合は、必ず弊社にご相談ください。安全の確認がとれない場合には、サービスの提供ができない場合がありますので、予めご了承ください。
  • 個人情報に関しては、個人が特定できないよう匿名化したうえでご提供ください。
  • お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後30日間保管し、当該期間の経過後に廃棄いたします。返却をご希望の場合は、事前にご相談ください。